El Instituto Nacional de Cooperativismo fue objeto de evaluación del MECIP por la Auditoria General del Poder Ejecutivo (AGPE), correspondiente al segundo semestre del 2018, ha arrojado la calificación máxima de 5 (cinco), cuya interpretación es Adecuado, quedando en primer lugar entre las Entidades Autonomas y Autarquicas, bajo la supervisión de la Autoridad de Control Externo de los entes Públicos.
Cabe destacar que este objetivo se logró bajo la actual Administración Institucional del Lic. Félix Hernán Jiménez Castro, ya que en el segundo semestre de 2015 habiamos terminado con una calificación de 2.1, con interpretación Deficiente, lo que representa un avance de 138%.